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SDS-PAGE胶配制及注意事项


       SDS-PAGE(十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳)是一种基于大小分离蛋白质的常用技术。通过使蛋白质变性并赋予其均匀的负电荷,在电场作用下蛋白质向正极迁移,根据大小进行分离。本文将详细介绍SDS-PAGE凝胶的配制方法及常见问题和解决对策。

 

一、 SDS-PAGE凝胶配制

        *注意事项:

        丙烯酰胺和双丙烯酰胺是神经毒素,操作时应佩戴适当的个人防护装备。总体积通常为10 mL,但可以根据需要调整。

        过硫酸铵(APS)作为引发剂,与TEMED一起使用可以加速聚合反应。

        缓冲液的体积会根据丙烯酰胺和双丙烯酰胺的体积进行调整,以确保总体积的准确性。

这些配方是基于常用的分离胶浓度,具体实验可能需要根据目标蛋白质的分子量范围进行调整。

 

        1. 分离胶配制

        (1)配方表:

         以下表格列出了不同浓度的分离胶的配方:

凝胶浓度  (%)

水   (mL)


30% 丙烯酰胺(mL) 1.5 M Tris-HCl (pH 8.8) (mL) 10% SDS (µL) 10% APS (µL) TEMED(µL)
6% 3.3 2 1 50 50 5
8% 4.6 2.6 1 100 100 10
10% 3.8 3.4 1 100 100 10
12% 3.2 4 1 100 100 10
15% 2.2 5 1 100 100 10


         (2)配制步骤:

         1. 清洁玻璃板和垫片:

         • 使用去离子水和乙醇彻底清洁玻璃板和垫片,确保没有残留物。

         2. 组装玻璃板:

         • 使用垫片将玻璃板组装在稳定、均匀的表面上,确保组装紧锁夹子,检查玻璃板完好性。

         3. 配制分离胶溶液:

         • 在干燥、干净的烧杯中按照配方表中的比例混合水、30%丙烯酰胺、1.5 M Tris-HCl (pH 8.8)、10% SDS、10% APS 和 TEMED。TEMED必须是最后          加入的成分。

         • 搅拌均匀后,立即倒入组装好的玻璃板中,确保均匀分布。

         • 用水或异丙醇覆盖凝胶表面,以保持均匀的表面,室温下凝固约 20-30 分钟。

 

         2. 浓缩胶配制

         (1)配方表:

         以下表格列出了浓缩胶的配方:

凝胶浓度   (%) 水   (mL) 30% 丙烯酰胺  (mL) 0.5 M Tris-HCl (pH 6.8) (mL) 10% SDS (µL) 10% APS (µL) TEMED (µL)
4% 6.14 1.06 3.3 100 100 10
5% 5.86 1.34 2.6 100 100 10
6% 5.28 1.72 3 100 100 10


          (2)配制步骤:

          1. 清洁玻璃板和垫片:

          • 使用去离子水和乙醇彻底清洁玻璃板和垫片,确保没有残留物。

          2. 组装玻璃板:

          • 使用垫片将玻璃板组装在稳定、均匀的表面上,确保组装紧锁夹子,检查玻璃板完好性。

          3. 配制浓缩胶溶液:

          • 在干燥、干净的烧杯中按照配方表中的比例混合水、30%丙烯酰胺、0.5 M Tris-HCl (pH 6.8)、10% SDS、10% APS 和 TEMED。TEMED必须是最             后加入的成分。

          • 搅拌均匀后,立即倒入组装好的玻璃板中,确保均匀分布。

          • 用水或异丙醇覆盖凝胶表面,以保持均匀的表面,室温下凝固约 20-30 分钟。

         

 

二、 可能出现的问题及解决方案

          在SDS-PAGE凝胶制备过程中,可能会遇到各种问题。以下是一些常见问题及其解决方案:

 

          1. 漏胶问题:

          • 原因:玻璃板未对齐或缺损,垫片密闭性不良。

          • 解决方案:确保玻璃板干燥,对齐后紧锁夹子,检查玻璃板完好性。

 

          2. 凝胶不凝固:

          • 原因:APS或TEMED失效,操作不当。

          • 解决方案:使用新鲜APS,确保TEMED未变质,避免胶未凝固前晃动。

 

          3. 凝胶凝固不均匀:

          • 原因:玻璃板未洗净,试剂有沉淀,混合不均匀。

          • 解决方案:彻底清洗玻璃板,确保试剂澄清透明,均匀混合组分。

 

          4. 凝胶中有气泡:

          • 原因:胶垫材质问题,插梳子不当。

          • 解决方案:使用实心软胶垫或保鲜膜,正确插入梳子。

 

          5. 上层胶边缘缺损:

          • 原因:玻璃板边条密闭性不良。

          • 解决方案:检查并更换边条,确保其密闭性。

 

          6. 拔梳子后泳道有胶丝:

          • 原因:TEMED 用量过多。

          • 解决方案:减少TEMED用量,确保在插梳子前胶未部分凝固。

 

          7. 拔梳子后泳道歪斜:

          • 原因:梳子与玻璃板不匹配。

          • 解决方案:确保梳子与玻璃板匹配,必要时更换。

 

          8. 上层胶中电泳出现“漏样”:

          • 原因:玻璃板与胶局部分离,上样缓冲液问题。

          • 解决方案:小心取下玻璃板,避免分离,上样时避免枪头插得太深。

 

          9. 泳道中心凹陷:

          • 原因:梳子插入后胶暴露于空气中时间过长。

          • 解决方案:尽量在 25 分钟内插入梳子,避免长时间暴露。

 

结语

          通过详细了解SDS-PAGE凝胶的配制方法及常见问题的解决方案,实验者可以有效提高实验成功率,减少误操作,从而获得高质量的实验结果。一块优质的SDS-PAGE胶能打好蛋白质电泳的基础,从而跑出清晰好看的条带,获得优质的实验结果。欢迎在阿拉丁进行优质试剂的采购,用高质量的试剂拿到高质量的结果。

 

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